هدايت و رهبري كليه امور دانشگاه در قالب تدابير و خط مشي هاي ابلاغي و سياستهاي كلان كشور.
1- رئيس دانشگاه صنعتي مالك اشتر:
1/1-اعمال تدابير، خط مشي های رئيس هيئت امناء در تنظيم طرح ها و برنامه هاي تحقيقاتي و آموزشي.
2/1-تهيه و تنظيم بودجه سالانه دانشگاه جهت طرح در هيئت امناء
3/1-تهيه و تنظيم و پيشنهاد مواردي كه تصويب يا اتخاذ تصميم نسبت به آن از اختيارات هيئت امناي دانشگاه و يا رئيس هيئت امناء مي باشد.
4/1-حفظ دارائي ها، اموال، اسناد و اوراق بهادار دانشگاه.
5/1-نمايندگي دانشگاه در كليه مراجع حقوقي، قضايي و انتظامي با حق وكالت در توكيل جهت دفاع از منافع دانشگاه.
6/1-انعقاد و اجراي قراردادها در صورت لزوم فسخ آنها و انجام تعهدات دانشگاه.
7/1-رهبري و هدايت و اجراي طرحها، برنامه ها و پروژه هاي تحقيقاتي و آموزشي مصوب.
8/1-ارائه مشاوره به مقامات ذيصلاح در زمينه مأموريت محوله به دانشگاه.
9/1-برقراري ارتباط با مراكز آموزشي و تحقيقاتي داخل و خارج كشور جهت استفاده بهينه از منابع و امكانات آنها و همچنين ارائه خدمات متقابل.
10/1-اقدام در مورد ثبت حق تملك و پروانه هاي اختراع مربوط به فعاليت هاي دانشگاه و تحصيل حق استفاده آـنها.
11/1-ايجاد نمايندگي در خارج از كشور به منظور برقراري ارتباط با مراكز آموزشي، تحقيقاتي و صنعتي مطابق آيين نامه ها و مقررات.
12/1-عزل و نصب مسئولين دانشگاه مطابق مقررات.
13/1-پيشنهاد تشكيلات كلان دانشگاه به هيئت امناء.
14/1-انجام ساير امور محوله از سوي مقامات
2- مشاورين:
جمع آوري اطلاعات مورد نياز و تجزيه و تحليل آنها به منظور ارائه خدمات مشورتي به رئيس دانشگاه در زمينه موضوعات تخصصي ذيربط.
3- دفتر رياست:
1/3-تنظيم برنامه جلسات و ملاقاتهاي(داخلي- خارجي)،(فردي- گروهي) رياست دانشگاه.
2/3-جمع آوري اخبار مجموعه هاي دانشگاه و تهيه گزارش هفتگي جهت بهره برداري مقام عالي وزارت و تهيه بولتن ماهيانه.
3/3-انجام كليه امور اداري حوزه رياست شامل مكاتبات، مراسلات و تنظيم نامه ها و موارد دستوري و امضايي.
4/3-ايجاد ارتباط اداري بين رياست دانشگاه و مسئولين واحدهاي متبوع و همچنين مراجع خارج از دانشگاه.
5/3-دريافت و نگهداري اسناد ويژه دانشگاه بصورت متمركز.
6/3-انجام امور پشتيباني و خدمات حوزه رياست.
7/3-انجام ساير امور محوله از طرف رئيس دانشگاه .
واحدهای ستادی و دانشگاهی
- سایت اصلی
- واحدهای ستادی
- معاونت آموزش و تحصیلات تکمیلی
- معاونت دانشجویی
- معاونت پژوهش و فناوری
- معاونت منابع انسانی
- معاونت برنامه ریزی،مالی و بودجه
- معاونت توسعه فناوری و ارتباطات بین الملل
- معاونت اجرایی اصفهان
- اداره بازرسی
- اداره عقیدتی سیاسی
- حوزه ریاست دانشگاه
- دفتر حقوقی
- مرکز تعالی خانواده
- مركز پردازش موازي و فوق سريع دانشگاه صنعتي مالك اشتر
- واحدهای دانشگاهی
- مجتمع دانشگاهی پدافند غیرعامل
- مجتمع دانشگاهی برق و الکترونیک
- مجتمع دانشگاهی شیمی و مهندسی شیمی
- مجتمع دانشگاهی علوم و فناوری های زیردریا
- مجتمع دانشگاهی علوم کاربردی
- مجتمع دانشگاهی فناوری اطلاعات،ارتباطات و امنیت
- مجتمع دانشگاهی مدیریت ومهندسی صنایع
- مجتمع دانشگاهی مکانیک و هوافضا
- مجتمع دانشگاهی مواد و فناوری های ساخت
- مجتمع دانشگاهی علوم و فناوری های هوادریا
- مجتمع دانشگاهی هوا و فضا
- دانشکده مهندسی برق و اویونیک
- دانشکده مهندسی مواد
- دانشکده مهندسی صنایع
- پژوهشکده الکتروسرام و فناوری های راداری
- پژوهشکده علوم و فناوری دفاعی شمال
- پژوهشکده علوم و فناوری دفاعی شمال غرب
- پژوهشکده علوم و فناوری دفاعی هرمزگان
- پژوهشکده فناوری زیستی
- پژوهشکده علوم و فناوری های ترکیبی(نخبگان جوان)