برنامه ریزی ،ارزیابی و نظارت در انجام پروژه ، سبب استفاده بهینه از منابع سازمان و افزایش بهره وری خواهد شد جهت دست یابی به این مهم ، دو دسته فعالیت عمده در این مدیریت صورت می پذیرد.
الف- برنامهریزی پژوهشی
1- تشکیل کانونهای تخصصی به منظور تهیه اسناد راهبردی و نقشه راه در حوزههای علم و فناوری مورد نیاز
2- تهیه برنامه پژوهشی 5 ساله با توجه به اسناد راهبردی
3- تهیه برنامه پژوهشی سالانه، دفاع در مراجع ذیربط و پیگیری تصویب و ابلاغ آن
4- ابلاغ برنامه پژوهشی مصوب هر مجتمع به تفکیک سرفصلهای مختلف اعتباری
5- پیگیری دریافت اعتبار برنامه مصوب پژوهشی از مراجع ذیربط و واگذاری به مجتمع بر اساس میزان پیشرفت تایید شده
6- دریافت گزارش عملکرد پژوهشی از مجتمعها و تهیه گزارشهای درخواستی از مراجع بالادستی
ب- ارزیابی و نظارت پژوهشی
1- بررسی پروپوزال پروژههای پیشنهادی
2- انعقاد قرارداد برنامههای مصوب پژوهشی با مجتمعهای دانشگاهی
3- نظارت بر اجرای قرارداد پروژههای پژوهشی و تایید میزان پیشرفت
4- بررسی و اظهار نظر در خصوص واگذاری پروژه به محققین و برونسپاری پروژههای پژوهشی